ToposPro
Программный пакет для геометрического и топологического анализа периодических структур (кристаллов, сетей, тайлингов). Программное обеспечение ToposPro включает в себя систему управления базами данных и ряд прикладных программ и процедур, многие из которых реализуют уникальные алгоритмы анализа кристаллической структуры.
Сайт: topospro.com
TopologyFinder
Скрипт для определения топологии кристаллической структуры по CIF файлу. Процедура определения топологии включает в себя обнаружение химических связей в кристаллической структуре, выявление принадлежности структуры к одному из химических классов с фиксированием строительных единиц, упрощение структуры до базовой сетки, вычисление набора топологических индексов и определение топологии базовой сетки по базе топологических типов.
Сайт: topcryst.com
OxidationStatePredictor
Скрипт для определения степени окисления для атомов металла в кислородном окружении по данным CIF файла. Процедура расчета степени окисления основана на прогностической схеме, подробно описанной в статье. В качестве дескрипторов используются положение атома в периодической системе и геометрические характеристики его полиэдра Вороного в кристаллической структуре.
Сайт: oxidationstate.topcryst.com
StructureStability
Скрипт для определения стабильности интерметаллических соединений по данным CIF файла. Процедура расчета основана на анализе плотности шаровой упаковки, в которой размеры шаров соответствуют радиусам атомов металла; метод подробно описан в статье. Скрипт позволяет рассчитывать факторы стабильности для всей структуры и для каждого отдельного атома структуры, при условии, что атомы имеют координационное число в пределах от 6 до 24. В соответствии со значениями факторов стабильности скрипт автоматически делает вывод о геометрической стабильности/нестабильности структуры в целом или окружения конкретного атома. Скрипт позволяет анализировать как полностью упорядоченные, так и разупорядоченные структуры интерметаллидов.
Сайт: structurestability.topcryst.com
PathFinder
Скрипт для определения карт миграции рабочих ионов по файлам CIF и POSCAR. Процедура поиска пути основана на анализе расстояний между ближайшими соседями и кристаллографической симметрии позиций атомов.
Сайт: pathfinder.batterymaterials.info